氨基柱是同時(shí)可以用于正相和反相條件的一種色譜柱。但正相溶劑和反相溶劑是不互溶的，這一點(diǎn)不能忽略。對(duì)于新購(gòu)柱子，首先請(qǐng)注意打開分析測(cè)試說明書，了解柱子的保存溶劑。如果保存溶劑與你將要使用的流動(dòng)相極性不同不會(huì)互溶，請(qǐng)先用異丙醇過渡。過渡過程中注意因異丙醇粘度較大，會(huì)導(dǎo)致柱壓很高，適當(dāng)調(diào)低流速。如果流動(dòng)相中還有緩沖鹽類，先用不含緩沖鹽的同比例流動(dòng)相過渡，避免緩沖鹽的析出。
柱效檢測(cè)： 流動(dòng)相：10％乙酸乙酯＋90％正己烷 流速1.0
標(biāo)準(zhǔn)溶液：乙苯（或甲苯）＋苯甲酸甲酯
檢測(cè)波長(zhǎng)254nm
這個(gè)方法特別適用于新購(gòu)柱子（新購(gòu)柱子往往保存在正相溶劑中）時(shí)即進(jìn)行檢測(cè)，如有問題，可及時(shí)與供應(yīng)商溝通。
（1） 平時(shí)在正相條件下使用：
首先用50倍柱體積的異丙醇清洗，因異丙醇粘度較大需適當(dāng)放低流速；之后，用50倍的甲醇清洗；之后，用異丙醇過渡回到平常使用的正相流動(dòng)相，即可。
（2）平時(shí)在反相條件下使用：
緩沖鹽應(yīng)及時(shí)沖洗，不能直接用純甲醇沖洗緩沖鹽等，屬常識(shí)就不作特別交待。
用50倍純甲醇沖洗；之后，用異丙醇過渡后，用二氯甲烷沖洗色譜柱；之后，再用異丙醇過渡回來到甲醇條件下。
這些清洗方法，主要是針對(duì)當(dāng)樣品中有雜質(zhì)逐步吸附累積到填料上時(shí)的處理方法，色譜柱表現(xiàn)行為為諸如柱壓增高柱效降低等。
一般C18或C8反相色譜柱，不能用純水沖洗，有機(jī)相比例至少5%，否則鍵合相碳鏈會(huì)發(fā)生卷曲，導(dǎo)致色譜柱性能不穩(wěn)定。
如果是正相柱，是肯定不能用水沖的，極少量的水都可能對(duì)色譜柱造成不可逆的損害。
其他柱，氨基柱由正相過渡到反相系統(tǒng)時(shí)，可以用堿性水溶液（pH不可過高，會(huì)水解）和純水沖洗，氨基柱一般不用純水，但可以用乙腈等的水溶液沖柱，但是不能長(zhǎng)時(shí)間沖。氨基柱跟氰基柱在水相中都有水解問題，用在反相系統(tǒng)時(shí)需特別注意pH值。
氨基柱活化是指新裝色譜柱在使用前要進(jìn)行老化處理，其目的是取出殘留的溶劑、水分和低沸點(diǎn)雜質(zhì)，同時(shí)也使固定液在載體表面形成均勻的膜。